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Diversite de populations microbiennes thermophiles d'une cheminée hydrothermale océanique profonde : cultures d'enrichissement en bioréacteur et isolement d'espèces nouvelles ArchiMer
Postec, Anne.
To explore the microbial diversity at deep sea vents, molecular techniques based on the analysis of the gene coding the 16S ribosomal RNA permitted to highlight a large archaeal and bacterial diversity. Nevertheless, the diversity of the hydrothermal microorganisms cultivated to date remains much lower than the diversity described with molecular tools. Innovative methods should therefore be used in order to cultivate new microorganisms, and also determine their metabolic properties and their potential role in the ecosystem. That was the purpose of this study: a bioreactor gas-lift was used to perform enrichment cultures in continuous, during 50 days, in thermophilic (60°C) and hyperthermophilic (90°C) conditions. A hydrothermal chimney sample (Rainbow...
Tipo: Text Palavras-chave: Strain isolation and characterization; Hybridization; Sequencing; Cloning; DGGE; Gas lift bioreactor; Enrichment cultures; Deep sea hydrothermal vents; Bacteria; Archaea; Diversity; Isolement et caractérisation de souche; Hybridation; Séquençage; Clonage; DGGE; Bioréacteur gas lift; Cultures d'enrichissement; Sources hydrothermales océaniques profondes; Bacteria; Archaea; Diversité.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/these-367.pdf
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Optimisation de la méthode de quantification de l'infection à Bonamia ostreae chez l'huître plate Ostrea edulis par P.C.R. quantitative ArchiMer
Dupin, Clément.
Le Laboratoire de Génétique et de Pathologie a développé un programme de recherche concernant la bonamiose, maladie due au protiste Bonamia ostreae. Le diagnostic de la maladie repose essentiellement sur deux techniques (histologie et la cytologie par apposition de tissus cardiaque), cependant la sensibilité de ces technique reste relativement faible. C'est pourquoi il est nécessaire de mettre au point une technique plus sensible, afin de pouvoir établir un diagnostic plus précoce de la maladie. Notre étude a porté sur le développement et la mise au point de la méthode de PCR quantitative sur une portion du gène de l'actine I de Bonamia ostreae récemment caractérisé. Les résultats obtenus ont permis de sélectionner le couple d'amorces les plus efficace...
Tipo: Text Palavras-chave: Bonamia ostreae; Ostrea edulis; PCR-Q; Clonage; Prémix Brillant (R); Réaction de polymérisation en chaîne (P.C.R.); Extraction d'ADN; Référence dye; Quantification absolue.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00368/47913/47942.pdf
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